染色体間の相互作用に関与するタンパク質の最初の同定

初めて提示された確率的ゲノム三次構造によるゲノム相互作用の形成の確率モデル

▲三次ゲノム構造シーケンシング技術とDNAイメージング技術を用いて、核スポットの周囲に形成された染色体間の相互作用を、それぞれ単一細胞レベルと細胞レベルで調べた.しかし、シーケンシングの結果、いくつかのゲノム領域が観察された.大きな相互作用を形成します。 これらの観察結果の違いを説明するために、核スポットとゲノム領域の間に形成される独立した相互作用に基づいて、染色体間の相互作用が確率論的に形成されるモデルが提案されています。 ひとつの確率のみが反映される単一細胞レベルでは、染色体間の相互作用は異なって見出されますが、すべての確率が反映されるクラスターレベルでは、染色体間の相互作用は大きなハブの形を示します。 上記のモデルの提示に続いて、染色体間相互作用を媒介すると考えられる 6 つの候補タンパク質 (MAZ、ZNF148、ZNF740、KLF5、ZNF263、KLF4) が選択されました。 候補グループを検証するために、候補グループごとにRNA干渉実験（RNA干渉）を行い、染色体間の相互作用の変化を観察しました。 したがって、ＭＡＺタンパク質の量を減らすと染色体間の相互作用が著しく減少することが観察されたことから、ＭＡＺタンパク質が染色体間の相互作用において重要な媒介因子であることが証明された（図および説明＝ＫＡＩＳＴ）。

3ゲノム構造の次元研究を通じて、 細胞核のゲノムは階層構造で構成されており、それぞれの構造がさまざまな遺伝子の発現調節に関与していることが知られています。. これらのゲノムも 3車の救助は癌です、 近年、加齢などの複雑な疾患において、疾患特異的な遺伝子発現と密接な関係があることが明らかになっています。. しかし、元のゲノムは 3一次構造は、比較的観察しやすい染色体内の相互作用にほとんど限定されていました。、 観察実験技術の限界により、大規模な染色体相互作用に関する研究はほとんど行われていません。.

カイストは、ソウル大学生命科学部のInkyung Jeong教授が率いる研究チームと、ソウル大学機械工学科のShin Yong University教授が率いる研究チームです。、 釜山大学の崔正模教授の研究チームとの共同研究による細胞核の中 3彼らは、ゲノムの新世代の次元構造の原理とそれを調節する媒介因子を発見しました。 十日は言います.

カイスト 生命科学科のチョ・ジェゴン博士とソウル大学のチョ・ソンヒョン研究員が率いるこの研究では、研究チームはマトリックス分解と呼ばれる分析手法を使用してゲノムを分析しました。 3一次構造データから染色体間相互作用情報を効率的に抽出できる新しい機械学習アルゴリズムを開発しました。、 これ DNA 画像技術で検証。.

研究チームは、分析アルゴリズムを使用して、複数の細胞株から染色体間の相互作用情報を抽出して分析しました。、 核斑(核内の非膜構造) 末梢染色体間の相互作用は一般に多くの細胞で保存されていることが観察された. さらに、研究チームはタンパク質認識配列を使用しました(DNAパターン) 分析は、染色の周りの染色体相互作用を示しました マズ タンパク質によって媒介されることが最初に発見された.

また、 研究チームは、染色体間の相互作用が単一細胞レベルで各細胞で異なる方法で発生することを発見しました。. 研究チームは、これまで知られていたことに反して、染色体間の相互作用が固定されていないことを発見しました。、 染色体間の相互作用の原理は、それが核体とゲノム領域との間の個々の相互作用によって確率論的に決定されることを示唆することによって最初に特定されました。.

この研究では、これまで知られていなかった形成原理と染色体相互作用の媒介因子を探ります。 マズ 大規模ゲノムにおけるタンパク質の役割の理解 3これは、自動車構造の基礎への手がかりを提供するという点で非常に重要です。.

この研究を行った カイスト チュ・ジェゴン統合修士・博士課程 “これまで実験技術の限界で見えなかった染色体間の相互作用の形成原理を明らかにした研究です。」と説明した. カイスト チョン・インギョン教授 “将来のゲノム 3一次構造による遺伝子発現制御や、がん疾患などで報告の多い染色体変異の原因究明の分野では、核小体 (核体)ゲノムとの相互作用の重要性を理解する上で期待される成果ˮ彼は研究結果を発表した。.

この研究結果は、国際ジャーナルに掲載されました`核酸研究(核酸研究、IF=19.16)」ために 4月 5公開された日付.

論文タイトル スペックルに関連する染色体間相互作用の確率的確立 午前.